[포켓몬 극장판1기] 뮤츠의 역습

흉폭하기 짝이 없는 뮤츠의 탄생은 비밀연구소에서 일하는 과학자들의 야심만만한 계획에서부터 시작된다.
 전설적인 포켓몬인 뮤의 머리카락 화석에서 DNA를 체취해 이를 토대로 뮤의 복제 포켓몬인 뮤츠를 만들어낸다.
 그러나 새로 창조된 뮤츠는 자신을 만든 인간들을 증오한다.
 (이것은 처음 영화가 시작되기 전에 사이드 스토리 뮤츠의 탄생에서 밝혀진다.
) 한편 로켓단의 두목인 비주기는 뮤츠를 이용해 세계를 정복하려 하지만 뮤츠는 스스로를 가장 강력한 포켓몬 트레이너라 칭하고 포켓몬 트레이너들을 뉴 아일랜드 성으로 초청해서 포켓몬들을 복제한다.
 뮤츠는 진짜보다 더 강력한 힘을 가진 복제 포켓몬들을 이용해 세계를 파괴하려하고 이를 막으려는 지우 행과의 대전쟁을 벌인다.