걸리 에어포스

갑작스럽게 나타난 수수께끼의 비행체 '자이(災)'에게 지구의 항공권을 빼앗기고 만 인류.
이에 대항하기 위해 기존의 전투기를 개조한 특수 병기 '도터'를 개발하고.
이 도터의 조종을 소녀의 모습을 한 아니마란 존재에게 맡기게 된다.
그런 상황 속에 중국에서 일본으로 향하는 배에 타고 있던 소년 나루타니 케이는 자이의 습격으로부터 배를 구해준 도터의 추락을 목격하게 되고.
파일럿을 구하고자 바다로 뛰어든 그는 간신히 올라탄 기체에서 그리펜이라는 아니마와 만나는데...